Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VtnP29788 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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