Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms