Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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