Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Hoxd10P28359 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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