Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms