Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms