Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Csn1s1P19228 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Csn1s1P19228 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Csn1s1P19228 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Csn1s1P19228 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Csn1s1P19228 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csn1s1P19228 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Csn1s1P19228 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Csn1s1P19228 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Csn1s1P19228 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Csn1s1P19228 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Csn1s1P19228 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Csn1s1P19228 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Csn1s1P19228 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Csn1s1P19228 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csn1s1P19228 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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