Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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P18524 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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P18524 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18524 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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P18524 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18524 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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