Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms