Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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