Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P10404 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms