Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UbbP0CG49 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms