Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 361.9 ms