Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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