Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 AC117245.4-202ENSMUST00000214403 3816 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Zmym5-203ENSMUST00000173954 5357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Heatr4-201ENSMUST00000164935 3038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Rbmx-201ENSMUST00000098470 3107 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Nfam1-202ENSMUST00000100377 2881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Hyal1-201ENSMUST00000010195 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Vps8-205ENSMUST00000118138 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms