Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Foxd2O35392 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms