Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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