Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms