Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 AC123534.1-202ENSMUST00000224256 1837 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Slc28a2-202ENSMUST00000110524 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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