Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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