Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cfap46E9Q2C0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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