Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf11E9PZM7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms