Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
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Usf3B2RUQ2 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Usf3B2RUQ2 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Usf3B2RUQ2 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Usf3B2RUQ2 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Usf3B2RUQ2 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Usf3B2RUQ2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Usf3B2RUQ2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Usf3B2RUQ2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Usf3B2RUQ2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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