Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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Gm6880A3KG45 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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Gm6880A3KG45 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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