Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Atp8b5A3FIN4 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Atp8b5A3FIN4 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Atp8b5A3FIN4 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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Atp8b5A3FIN4 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Atp8b5A3FIN4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Atp8b5A3FIN4 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Atp8b5A3FIN4 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Atp8b5A3FIN4 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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