Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Mrpl40Q9Z2Q5 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Mrpl40Q9Z2Q5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Mrpl40Q9Z2Q5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Mrpl40Q9Z2Q5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Mrpl40Q9Z2Q5 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Mrpl40Q9Z2Q5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Mrpl40Q9Z2Q5 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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