Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms