Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Rnft1Q9DCN7 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnft1Q9DCN7 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnft1Q9DCN7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnft1Q9DCN7 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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