Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms