Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx29Q9D3S3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx29Q9D3S3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms