Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms