Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Zbed3Q9D0L1 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Zbed3Q9D0L1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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