Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PmpcbQ9CXT8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PmpcbQ9CXT8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PmpcbQ9CXT8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PmpcbQ9CXT8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PmpcbQ9CXT8 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PmpcbQ9CXT8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PmpcbQ9CXT8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PmpcbQ9CXT8 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PmpcbQ9CXT8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PmpcbQ9CXT8 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PmpcbQ9CXT8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms