Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ddx28Q9CWT6 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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