Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms