Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms