Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CPS8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CPS8 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms