Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ubqln4Q99NB8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ubqln4Q99NB8 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ubqln4Q99NB8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ubqln4Q99NB8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ubqln4Q99NB8 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ubqln4Q99NB8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ubqln4Q99NB8 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ubqln4Q99NB8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ubqln4Q99NB8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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