Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms