Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms