Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Hps4Q99KG7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hps4Q99KG7 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hps4Q99KG7 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hps4Q99KG7 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps4Q99KG7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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