Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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