Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pacsin3Q99JB8 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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