Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIK8

Rfwd3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, mousemouse

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd3Q8CIK8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfwd3Q8CIK8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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