Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Fbxo48Q8CAT8 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Fbxo48Q8CAT8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Fbxo48Q8CAT8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Fbxo48Q8CAT8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Fbxo48Q8CAT8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms