Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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