Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp47Q8BY87 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Usp47Q8BY87 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Usp47Q8BY87 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Usp47Q8BY87 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Usp47Q8BY87 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Usp47Q8BY87 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Usp47Q8BY87 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp47Q8BY87 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp47Q8BY87 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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