Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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