Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms