Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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